故事发生在很久很久以前，久远到甚至已经追溯不到具体的时间，地球上早已诞生了人类的痕迹，随着时间长河慢慢的流淌，这些古人类慢慢的发展，而后渐渐的发展出了一个辉煌的文明，但好景不长，来自广阔无垠的宇宙中一个极其邪恶而又强大种族——虫族悄然盯上了地球这一颗美丽的星球，开始大肆进攻地球文明。地球文明奋起反抗，但在那无边无际的虫潮之下依旧被打的节节败退，就在人们渐渐的陷入绝望之际。忽然间，世界各地的战场上，一位又一位活力四射的美丽少女站了出来，她们使用着一种未知的能量，在两名最强的少女的领导下与军队合作，就这样在少女们的帮助之下。古人类终于获得了喘息的空间。
古人类称这群少女为神使团，而正是神使团的出现，使猖獗的异虫陷入了颓势，渐渐的龟缩了起来，古人类也在其中看到了消灭异虫的希望。他们趁异虫应接不暇悄然摸索到了异虫们的老巢，在进行了军队的整合后，开展了最终的决战！
一批又一批的军队在神使团的两位首领的带领下源源不断的朝着异虫的巢穴推进，即使是以前无往不利的虫群战术，在古人类与神使的配合下依旧被打的节节败退，渐渐的大军一路横推到异虫巢穴的腹地。
“姐姐，我觉得好奇怪。这些恶心的虫子往常不杀都杀不完的吗？这次怎么刚打不久虫潮都没有明显的损失就撤退了！”大军前方一个黑发少女对着大军领头的白发少女说道。
“是啊，我也觉得奇怪！不好！我们中埋伏了！该死！这群虫子竟然有智慧！全军听我号令，加快速度，尽快捣毁虫巢！”就在白发少女话音刚落，一只只长得非常恶心的虫子从大军的四周将大军围了起来。
“该死的！被摆烂一道！没办法箭在弦上不得不发了。妹妹！”
“明白!”黑发少女点了点头。随后二人手中猛然绽放出耀眼的光芒，随着二人的动作。两条散发着圣洁气息的光柱猛然贯穿了密密麻麻的虫群，而后他们开始一边用火力压制虫群的蔓延，一般加快行军的速度。
在他们的不懈努力下，大军终于打到了虫巢的所在地。但在过程中大军也损失惨重，一路上处处都躺着异虫或者人类的尸体。
“主宰，觉悟吧！这回你可逃不掉了！”白发少女轻灵的声音在诡异而又恶心的虫巢前回响。
“桀桀桀，该死的魔法少女，都追到这里来了吗？不过也好将你们这些人都消灭了，以后这颗星球就是我们的地盘了！哈哈哈！”一个阴冷而又诡异的声音从虫巢中传出。
“梦该醒了！这一战我们是绝对不会输的！”黑发少女直接一发光弹重重的轰在虫巢核心之上而随着她的动作，黑发少女身后的军队见状，也开始向核心集火。
‘砰砰砰’巨大的爆炸声在空中不断的响起带来了浓密的尘雾。即使明知击中了，但黑发少女严肃的面孔依旧没有放松下来，只见她挥了挥手示意军队停火，但她依旧在紧张的盯着半空中烟雾的源头之处。
不久后，烟雾散去，在两位少女难看的面容下露出了完好无埙的虫巢核心。
“桀桀，没有用的，就这种程度的攻击，是无法摧毁核心的。看来你们的手段都用尽了啊！接下来该到我来反击了。孩子们！帮我好好的招待招待远方而来的客人！”神秘的声音在空旷的山谷中回荡。
随后，密密麻麻的虫海慢慢的从地底钻出,将人类军队包围在中间并不断的缩紧，浩浩荡荡的大军在无尽的虫海之下被打的节节败退，白发少女看着手下一个一个牺牲，露出了悲伤的神色，她知道这一战已经失败，她们这一次怕是凶多吉少，忽然她眼神流露出一抹决然之色，她对着她身后的妹妹点了点头。
黑发少女看着她姐姐坚定的眼神，明白了什么也点了点头回应。看到妹妹回应之后，白发少女和黑发少女缓缓站定，看着簇拥着她们都军队仿佛在交代遗言一般道：“将士们，感谢你们这一路的陪伴。现在是我们履行使命的时候了！接下来我们将集合所有圣使的力量来彻底消灭异虫，以后就靠你们来守护人们了！”
话音落下，姐妹二人双手相接，温暖圣洁的白光将二人包裹，而后一颗又一颗的七彩的光球迅速的从世界各地朝她们飞来，一颗一颗融入姐妹二人的身体，随着光球的涌入，纯洁无瑕的白光慢慢的被染成了彩虹的颜色。
“异虫！觉悟吧！今天就是你们消失之日！”姐妹二人齐声说道！七彩的光团猛然炸开。
“不！！！！！”伴随着一声强烈的惨叫，遍布着血管的虫巢渐渐的失去了活力变成了石头一般都死寂的灰色。
做完这些的姐妹二人互相看着对方随即露出了一个的美丽的笑容，但二人的眼中却并没有丝毫胜利的喜悦，有的只有浓浓的不舍。就在身边有人想要搀扶她们的时候，二人身体中开始渐渐有光点飞出消散在空中，随后愈来愈多的光点从中飞出，二人的身影也愈发的虚幻，转眼间二人就已经化为光点消散在世间。随着光点消失的还从那一战以后，世间再无圣使，而随着圣使消失的还有那个诡异的虫巢。
而在圣使与虫巢同归于尽之后，剩下的异虫犹如无根之水一样，在人类军队的进攻之下，渐渐的消失，就这样肆虐已久的虫灾在两名少女的牺牲之下平息了。
可是因为异虫入侵的古人类文明早已元气大伤，文明根基早就在无穷无尽的虫海中毁于一旦，最终随着最后一名古人类的逝去，盛极一时的古人类文明最终还是没能抵御世间长河的冲刷，迎来了属于他们的最终落幕。
又不知过了多久，深邃的大海深处再次诞生了生命的痕迹。随着生命的出现，那消失了不知多久的破败虫巢也随之再次出现在了大地之上，然伴随着虫巢的出现，很快一道白色的光柱也随之而来。只能光柱一分为二化为一黑一白两道光柱对称的立在了虫巢的两边，很快光柱消失徒留下两根精致的石柱，两根石柱顶端分别镶嵌着一黑一白两颗精美的宝石，而随着石柱的形成，虫巢很快就消失不见。
直到一个激动的男声打破了一处寂静的山谷中的宁静。
“嘿，韵雪。快看快看，山谷中好像有什么不得了的东西。啧啧啧，意外收获啊！”
“咦，我看看。是什么让我们得陈宇陈教授这么激动。”一个如黄鹂清脆啼叫声一般的声音从不远处传来。
“这次迷路可真的迷路对了！这可是一个震惊世界的大发现！”男人兴奋的声音再次响起。
伴随着‘哒哒哒’脚步声的越来越近，名为韵雪的女性来到了被她称为陈教授的身旁，她顺着男人视线的方向看去，远远望去一个古朴的遗迹正矗立在大地之上，她不由的瞪大了双眼，一边激动的说道一边朝前方快步走去：“哇！这！古人诚不欺我。我有一种预感，这次我们发现遗迹会对解读神农架地区人类古文明的起到很大的作用！陈宇，你还在等什么呀！快去近距离观察啊！这可是人类首次在神农架深处发现的古代遗迹呢！”
“唉唉唉！韵雪，别那么急啊！等等我！”被称为陈宇的男人一边回应一边朝前追去。
这二人的来头可不小，男性名为陈宇是一个赫赫有名的古文化学者。女性名为林韵雪，是一个不折不扣的大美人 ，同时也是一位有名的生物学家。二人是一对新婚夫妻，正在神农架旅游度蜜月。不幸的是二人转神农架深处探险的时候迷失了方向，不知不觉之中，走入了一个诡异的山谷，还好他们提前准备了卫星电话，不过就在他们准备呼救的时候，忽然山谷中隐约可见的一根石柱吸引了正在观察四周的陈宇的注意，于是二人打算进去探索一下这个神秘的山谷。
不久后二人走到了遗迹面前，发现这个遗迹是一个古代祭祀的神明祭坛，祭坛的周围被巨大的石壁，陈宇远远就看见石壁上刻着一些古怪的文字，他走进仔细的观察而后与他脑海中的知识进行对比。
与此同时，林韵雪则是静静的盯着祭坛的中心仿佛在思考着什么，忽然她瞳孔一震，一个诡异的‘石块’缓缓出现在她的视线中，如若不是石块有着血管的印记，她还真的不能确定这是某种生物的遗骸。
“陈宇，陈宇！看这，你阅读的古籍中有没有关于这种生物的记载啊。”林韵雪指着祭坛中心向正在研究石壁上的文字的陈宇问道。
陈宇向她指的地方看了看，发现什么也没有，疑惑的问道：“老婆大人，你看见什么了？你指的地方什么也没有啊！”
“那么大一个化石你都看不见吗？”林韵雪一边向祭坛中心的‘化石’走去，一边疑惑的询问道。
“祭坛的中心真的什么都没有啊！是不是遗迹里有奇奇怪怪的东西，让你出现幻觉了？”陈宇丈二和尚摸不着头脑，在他的视线中，什么都没有。
“明明就在这啊！”林韵雪将手搭在‘化石’之上，试图向陈宇证明‘化石’的存在。当林韵雪的手上碰在‘化石’上的易损件，‘化石’仿佛感受到了什么，外壳之内死寂的虫巢再度散发起不详的紫光，只不过在石壁的封锁之下，并没有传播出去。
陈宇慢慢向她走了过来，当他准备将手与韵雪的手持平的时候。
在林韵雪的视角中，‘化石’上迅速的布满裂纹，随即无数的散发着不详气息紫色粒子疯狂的从裂纹中涌出，很快那些不详的紫色粒子汇聚成了一片紫色的海洋。
林韵雪呆呆的看着这片紫色的海洋，忽然由粒子构成的海洋动了。粒子忽然散开，以极快的速度将她包围在中心，随后缓缓的融入了她的身体之中。林韵雪只知道一股浓浓的困意突然在她的脑海中蔓延，随后她两眼一黑便失去了意识。
在陈宇的视线中，林韵雪正在发呆，忽然，她的身躯猛然向下倒去。还好他反应快。顺势将林韵雪接入了怀中。
就在林韵雪被林宇抱住的一瞬间。矗立在祭坛两旁的石柱顶端突然绽放出圣洁的光芒，温和的光芒缓缓的照耀在昏迷的林韵雪的娇躯之上。随后光芒渐渐的消失。而后从石柱的顶端飞出了一黑一白两颗宝珠，宝珠悬浮在陈宇的面前，陈宇下意识的将宝珠接在手中。
随后陈宇感觉一股信息慢慢的涌入了他的脑海之中，他轻轻的闭上眼，来吸收这些知识。在吸收信息的过程中他惊喜的发现，这些信息中竟然包含了那中不知名古文字的知识。
随后只见陈宇轻轻的将昏迷的妻子靠在石壁之上，随后将宝珠放入怀中，随后快速的拨通了报警电话。做完这些，他轻轻的走到了刻着古文字的石壁前，用刚刚获得的知识解读了起来。
伴随着陈宇的阅读，他原本松弛的眉头渐渐的绷紧，随后他坚定的看了看昏迷的妻子暗暗下定了决心。
不久后，昏迷的林韵雪也醒了过来，搜救人员也成功将二人救出，二人的神农架之行也随之结束，很快二人的生活再次回归了原来的轨迹，二人继续过上了幸福的生活，一年以后，夫妻二人的爱情孕育出他们爱情的结晶。
故事结束了吗？不，命运齿轮的转动已经不可阻挡，真正的故事现在才开始！